При царевне Софье Алексеевне в Новодевичьем монастыре развернулось новое грандиозное строительство. Было обновлено большинство монастырских построек.

За короткое время в 1689-1690 гг. возведена высокая шестиярусная колокольня (72 м.) в стиле нарышкинского барокко, приписываемая зодчему Якову Бухвостову. Первый ярус колокольни имеет два этажа. Церковь Варлаама и Иоасафа, царевича Индийского находится на первом этаже нижнего яруса. В свое время на втором этаже была устроена печь.

В среднем ярусе колокольни располагался храм апостола Иоанна Богослова.